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科學家們目前已經(jīng)從新冠病毒中分離出至少6個不同的毒株。他們表示，盡管病毒發(fā)生了變異，但幾乎沒有變化，這對正在研制可行疫苗的研究人員來說是個好消息。

這些是對新冠病毒測序進行的最廣泛的研究的結(jié)果。博洛尼亞大學（the University of Bologna）的研究人員對48,635個病毒基因組進行了分析，這些基因組是由世界各地實驗室的研究人員分離出來的。這項研究發(fā)表在《微生物學前沿》（Frontiers in Microbiology）雜志上，題為“Geographic and Genomic Distribution of SARS-CoV-2 Mutations”。

在這些基礎(chǔ)上，研究人員就有可能繪制出病毒傳播到各大洲期間發(fā)生的傳播和變異。初步結(jié)果令人鼓舞：新冠病毒幾乎沒有變化，每個樣本大約有7個突變。普通流感的變異性率則達到了新冠病毒變異率的兩倍多。

“新冠病毒可能已經(jīng)優(yōu)化到可以影響人類，這就解釋了它的低進化變化，”尤尼博研究員、這項研究的協(xié)調(diào)員費德里科·喬吉(Federico Giorgi)解釋說：“這意味著我們正在開發(fā)的治療方法——包括疫苗，可能對所有的病毒毒株都有效。”

目前，新冠病毒共有六種毒株。最早的是L型菌株，于2019年12月在武漢出現(xiàn)。它的第一個突變株S株出現(xiàn)在2020年初。而從2020年1月中旬開始，我們已經(jīng)有了V株和G株。到目前為止，G株是最廣泛的：它在2020年2月底突變?yōu)镚R株和GH株。

“到目前為止，G株及其相關(guān)的GR和GH株傳播最廣，占我們分析的所有基因序列的74%，”Giorgi說。“他們出現(xiàn)了四種突變，其中兩種能夠改變病毒的RNA聚合酶和刺突蛋白的序列。這一特征可能促進了病毒的傳播。”

如果我們看看冠狀病毒分布圖，就會發(fā)現(xiàn)菌株G和GR在歐洲和意大利最常見。根據(jù)現(xiàn)有的數(shù)據(jù)，生長突變在意大利幾乎不存在，而在法國和德國出現(xiàn)的頻率更高。這似乎證實了上個月采取的控制措施的有效性。

在北美，最廣泛的毒株是GH；而在南美洲，GR毒株更常見。在武漢L菌株最初出現(xiàn)的亞洲地區(qū)，G、GH和GR的傳播呈上升趨勢。這些病毒在歐洲傳播一個多月后，于3月初才登陸亞洲。

從全球范圍來看，菌株G、GH和GR不斷增加。在美國和西班牙的一些限制地區(qū)可以發(fā)現(xiàn)S菌株。而L型和V型菌株正在逐漸消失。

除了這6種主要的新冠病毒毒株之外，研究人員還發(fā)現(xiàn)了一些不常見的突變，這些突變目前并不令人擔憂，但仍應(yīng)加以監(jiān)測。

具體而言，在測序完整病毒基因組數(shù)量最高的前40個國家中（圖1C），與世界平均水平相比，以下國家的每個樣本中觀察到的突變數(shù)量略有但明顯更高：印度（8.40），剛果（8.30），孟加拉國（9.83）和哈薩克斯坦（9.47）。另一方面，來自以下國家或地區(qū)的序列顯示出較低的突變負擔：德國（6.09），日本（4.55），意大利（5.92），希臘（5.91），中國香港（5.00）和肯尼亞（5.38）。必須注意的一點是，一些抽樣偏差可能會影響這一比較：例如，一些國家在大流行的早期階段產(chǎn)生了最高數(shù)量的序列（如意大利），因此可能只觀察到了較少的突變。

圖1：（A）所有SARS-CoV-2基因組樣本的突變事件數(shù)量分布。（B）每個樣本的突變數(shù)分布，按大陸劃分。（C）標志了在全國范圍內(nèi)進行分層，使用40個測序基因組最多的國家。

“罕見的基因組突變不到全部測序基因組的1%，”Giorgi證實。“然而，我們對它們進行研究和分析是最基本的，這樣我們就可以確定它們的功能并監(jiān)測它們的傳播。所有國家都應(yīng)該通過提供有關(guān)病毒基因組序列的數(shù)據(jù)，為這一領(lǐng)域做出貢獻。”