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中國(guó)科學(xué)院微生物研究所趙瑞琳?qǐng)F(tuán)隊(duì)用系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)重塑廣義蘑菇科分類(lèi)系統(tǒng)
蘑菇科Agaricaceae是擔(dān)子菌門(mén)中物種最為豐富、形態(tài)類(lèi)型高度多樣的類(lèi)群之一，長(zhǎng)期以來(lái)由于分類(lèi)體系不穩(wěn)定嚴(yán)重阻礙相關(guān)資源的保護(hù)和可持續(xù)利用。近日，中國(guó)科學(xué)院微生物研究所趙瑞琳?qǐng)F(tuán)隊(duì)通過(guò)整合多基因系統(tǒng)發(fā)育、系統(tǒng)發(fā)育基因組、演化時(shí)間估算及形態(tài)學(xué)證據(jù)，系統(tǒng)重建了廣義蘑菇科（Agaricaceae sensu lato）的分類(lèi)框架，為該類(lèi)群提供了穩(wěn)定且具有演化時(shí)間依據(jù)的系統(tǒng)分類(lèi)體系。相關(guān)論文在Fungal Diversity在線發(fā)表，題目為“Disentangling taxonomic chaos in Agaricaceae s.l.: an integrative phylogenomic framework with divergence dating reconstructs classification”。
該研究共研究了2011–2025年間的采集及其它菌物標(biāo)本館的借研材料共1255份標(biāo)本，分別構(gòu)建多基因、基因組系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，并結(jié)合形態(tài)學(xué)與演化時(shí)間證據(jù)，將廣義蘑菇科區(qū)分為狹義蘑菇科、馬勃科、鬼傘科、釘灰包科和疣孢環(huán)柄菇科；狹義蘑菇科內(nèi)分別建立四個(gè)亞科；建立2個(gè)新屬，43個(gè)新種，10個(gè)新組合。
圖.廣義蘑菇科主要類(lèi)群的系統(tǒng)發(fā)育及演化時(shí)間格局
該研究不僅系統(tǒng)解決了廣義蘑菇科數(shù)十年來(lái)的核心分類(lèi)爭(zhēng)議，展示了系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)與演化時(shí)間估算在復(fù)雜真菌類(lèi)群分類(lèi)研究中的關(guān)鍵價(jià)值，也為食用菌資源利用、毒蘑菇鑒別及真菌多樣性評(píng)估提供了穩(wěn)定可靠的分類(lèi)基礎(chǔ)。
中國(guó)科學(xué)院微生物研究所博士研究生李賈鑫為論文第一作者，趙瑞琳研究員為通信作者。本研究得到科技部科技基礎(chǔ)資源調(diào)查專(zhuān)項(xiàng)、西藏自治區(qū)科技計(jì)劃項(xiàng)目、青海省大型真菌多樣性調(diào)查項(xiàng)目、神農(nóng)架?chē)?guó)家公園本底資源調(diào)查等項(xiàng)目資助。
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