寧陜齒突蟾和六盤齒突蟾線粒體基因組比較及中蛙亞目系統(tǒng)發(fā)育研究
無(wú)尾目(Anura)是脊椎動(dòng)物兩棲類一個(gè)較大的研究較深入的類群,目前GenBank已收錄超過(guò)200種無(wú)尾目線粒體基因序列.中蛙亞目(Mesobatrachia)是無(wú)尾目中一個(gè)類群,物種種類眾多,多樣性強(qiáng),但目前僅有21種物種的線粒體基因組被報(bào)道,研究尚不完善.齒突蟾屬(Scutiger)作為中蛙亞目中一個(gè)重要的分類單元,包含物種多為稀有瀕危種類,然而缺乏線粒體全基因組序列報(bào)導(dǎo),對(duì)該屬的分類研究造成許多困擾.基于此,本研究對(duì)齒突蟾屬的物種寧陜齒突蟾(Scutiger ningshanensis)和六盤齒突蟾(Scutiger liupanensis)進(jìn)行線粒體基因組測(cè)序并分析,以期為齒突蟾屬及相關(guān)物種的分類學(xué)研究進(jìn)一步提供分子研究證據(jù).研究采用PCR技術(shù),結(jié)合引物步移法及基因組步移法進(jìn)行產(chǎn)物測(cè)序,利用生物信息學(xué)手段對(duì)測(cè)得的片段進(jìn)行拼接,注釋和分析,結(jié)合NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中已收錄的21種中蛙亞目線粒體基因組序列信息,分別以PCGs,rRNAs,rRNAs PCGs為數(shù)據(jù)集,以新蛙亞目的中國(guó)林蛙(Rana chensinensis)以及中國(guó)雨蛙(Hyla chinensis)為外群,采用最大簡(jiǎn)約法(Maximum Parsimony, MP),最大似然法(Maximum Likehood, ML)和貝葉斯推論法(Bayesian Inference, BI)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,進(jìn)行中蛙亞目各物種的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的分析.
本文來(lái)自[1]范瑞娜. 寧陜齒突蟾和六盤齒突蟾線粒體基因組比較及中蛙亞目系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 陜西師范大學(xué), 2016.的摘要部分。
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